Informations

« événement de désorientation » est-il un terme courant parmi les biologistes ?


Sur la page Web du ministère des Ressources naturelles de la Caroline du Sud concernant le programme de conservation des tortues marines, il est écrit : « Lorsqu'une tortue de mer nouveau-née est attirée loin de l'océan vers une source de lumière directe ou indirecte, les biologistes décrivent cela comme un événement de désorientation ».

Est-ce que quelque chose comme le événement de désorientation décrivant le comportement des tortues marines existe-t-il également chez d'autres espèces ?


Comme une sorte de réponse « enseigner à pêcher », abordons comment répondre à une question comme celle-ci :

Google Scholar est un assez bon index de littérature scientifique : assez bon à cet effet. Si vous recherchez :

"événement de désorientation" -tortue

vous renverrez tous les résultats qui utilisent la phrase spécifique « événement de désorientation » sauf ceux qui mentionnent les tortues.

Vous pouvez aussi faire la recherche :

tortue "événement de désorientation"

pour trouver les papiers de tortue. À ce jour, « événement de désorientation » renvoie 57 résultats ; 14 incluent également le mot "tortue", 43 ne le font pas.

Parmi les 43, il semble que la majorité des articles discutent Humain désorientation, en particulier dans le contexte de pilotes humains mais aussi dans le cadre d'individus déficients cognitifs ou simplement de piétons égarés. Il y a un article qui utilise le terme se référant aux rats dans une tâche semblable à un labyrinthe.

Globalement, ces résultats m'amènent à conclure que "l'événement de désorientation" est ne pas un terme général commun utilisé par les biologistes pour désigner les espèces autres que les tortues qui se perdent, bien que je dirais aussi que je m'attendrais à ce qu'un biologiste comprenne la signification du terme dans un contexte suffisant.


Je ne connais que la recherche sur les oiseaux et c'est ne pas un terme couramment utilisé en ornithologie. Les oiseaux utilisent plusieurs méthodes de navigation, notamment le soleil, les étoiles et le champ magnétique terrestre. Lorsque les biologistes parlent de désorientation des oiseaux (généralement à cause des champs magnétiques ou ils pourraient apparaître être désorienté après un événement de retombées, à cause d'un ouragan, etc.), ils ne le considèrent pas comme un événement de désorientation, pour autant que je sache, il n'y a pas de terme pour décrire ces événements en ornithologie.

J'ai l'impression que je devrais clarifier, car j'ai utilisé un terme et j'ai ensuite dit qu'il n'y avait pas de terme… Les « retombées » ou les retombées de migration, c'est lorsque des conditions météorologiques extrêmes empêchent les oiseaux d'atteindre leur destination (par exemple, les zones de reproduction ou d'hivernage) et de se réfugier à la place. dans un lieu insolite (ce que l'on pourrait considérer comme inhabituel, car ce n'est pas leur chemin normal de migration, pas leur site d'escale "normal"). Il ne s'agit pas en fait de désorienter les oiseaux, c'est pourquoi je dirais que ce n'est pas un terme pour décrire un événement de désorientation.


Les effets biologiques des événements traumatiques

Nous pensons souvent que le TSPT est un trouble psychologique qui cause de grandes souffrances aux personnes qui ont vécu des événements traumatisants. Maintenant, l'auteur principal d'une nouvelle étude soutient que ces événements traumatisants peuvent en fait provoquer des changements chez la victime au niveau moléculaire. L'hôte Guy Raz s'entretient avec le Dr Sandro Galea de l'Université Columbia au sujet de l'étude.

Nous considérons généralement le TSPT comme un trouble psychologique, un trouble qui peut déchirer la vie des anciens combattants et d'autres personnes qui ont vécu des événements traumatisants. Mais une nouvelle étude suggère que ces événements traumatisants peuvent en fait changer les gens au niveau moléculaire, et ce pourraient être ces changements moléculaires qui conduisent aux symptômes du SSPT.

Sandro Galea est l'auteur principal de l'étude. Il est également président du département d'épidémiologie de l'Université Columbia. Bienvenue au programme.

Dr SANDRO GALEA (Président, Département d'épidémiologie, Columbia University) : Merci de m'avoir invité.

RAZ : Votre étude semble en quelque sorte suggérer un cadre biologique complètement nouveau pour le TSPT, quelque chose que nous avons longtemps – en quelque sorte associé à un état psychologique. Décrivez comment cela fonctionne maintenant, comment vous pensez que cela fonctionne.

Dr. GALEA : Ce que nous pensons, c'est que le traumatisme subi par quelqu'un entraîne des changements moléculaires autour de l'ADN qui entraînent des changements dans les gènes qui sont exprimés et non exprimés. Notre étude a donc montré que les personnes qui subissent des événements traumatisants sont plus susceptibles de présenter ces changements épigénétiques moléculaires, ce qui peut expliquer en partie pourquoi certains gènes sont alors exprimés ou non, et entraînent des symptômes du trouble psychologique.

RAZ : Vous décrivez des changements épigénétiques. En bref, pouvez-vous expliquer ce que cela signifie?

Dr GALEA : Le terme changements épigénétiques fait référence à des molécules particulières qui adhèrent à des parties particulières de l'ADN. Ce ne sont donc pas des changements génétiques, ce ne sont pas des changements dans le codage génétique que nous avons tous en nous, mais ce sont des changements autour de l'ADN.

Ainsi, un exemple serait que l'un des symptômes cardinaux du trouble de stress post-traumatique est l'hypervigilance - être très nerveux, constamment sur ses gardes. Et nous avons découvert que certains des gènes que nous connaissons sont responsables de la vigilance, de la nervosité, font partie des gènes qui ont ces changements épigénétiques associés à l'expérience de l'événement traumatique.

RAZ : Comment pouvez-vous savoir si ces différences moléculaires entre les personnes avec et sans TSPT causent le trouble, plutôt que résultent du trouble ?

Dr GALEA : C'est un défi de déterminer si ces changements moléculaires sont à l'origine du trouble ou sont le résultat du trouble. Nous avons un certain nombre d'analyses dans l'article qui montrent, par exemple, que plus les gens vivent d'événements traumatisants, plus ils subissent de changements moléculaires. Cela, bien sûr, suggère que les changements moléculaires sont le résultat des événements traumatisants, et non l'inverse.

RAZ : Sandro Galea, que pensez-vous que toutes ces recherches pourraient signifier pour la façon dont le trouble de stress post-traumatique pourrait être compris, et également traité à l'avenir ?

Dr GALEA : Le plus proche est de considérer ces changements moléculaires comme un marqueur du SSPT. Et il est loin d'ici au traitement. Mais en même temps, comprendre comment se produit le SSPT est ce qui mènera finalement à de meilleures interventions thérapeutiques.

RAZ : L'étude de Sandro Galea sur la biologie du SSPT a été publiée en ligne cette semaine dans les « Actes de la National Academy of Sciences ». Il nous a rejoint de l'Université de Columbia. Sandro Galea, merci beaucoup.

Dr GALEA : Merci beaucoup de m'avoir invité.

Copyright & copie 2010 NPR. Tous les droits sont réservés. Consultez les conditions d'utilisation et les pages d'autorisations de notre site Web à l'adresse www.npr.org pour plus d'informations.

Les transcriptions NPR sont créées dans les délais impartis par Verb8tm, Inc., un entrepreneur NPR, et produites à l'aide d'un processus de transcription exclusif développé avec NPR. Ce texte peut ne pas être dans sa forme définitive et peut être mis à jour ou révisé à l'avenir. La précision et la disponibilité peuvent varier. L'enregistrement faisant autorité de la programmation de NPR&rsquos est l'enregistrement audio.


Q&A sur les événements de coagulation rares qui ont causé la pause J&J

Le comité consultatif sur les pratiques d'immunisation des Centers for Disease Control and Prevention a voté le 23 avril pour reprendre l'utilisation du vaccin Johnson & Johnson COVID-19 avec un avertissement selon lequel il pourrait provoquer une maladie de coagulation sanguine très rare, mais dangereuse.

Le vote de 10 à 4 est intervenu 10 jours après que le CDC et la Food and Drug Administration ont recommandé le 13 avril « une pause dans l'utilisation » du vaccin Johnson & Johnson COVID-19 « par prudence », en raison de six rapports d'un caillot sanguin rare combiné à de faibles niveaux de plaquettes sanguines parmi plus de 7 millions de vaccins J&J administrés.

Lors de la réunion du 23 avril, un scientifique du CDC a présenté neuf cas supplémentaires signalés, portant le nombre total de cas confirmés à 15 sur près de 8 millions de doses de vaccin, au 21 avril. Trois des 15 sont décédés et quatre restent en soins intensifs.

Nous allons examiner ces maladies rares, leur fréquence et les risques de COVID-19.

Que savons-nous des six cas, et y en a-t-il eu plus depuis que la pause a été recommandée le 13 avril ?

Les six premiers cas faisaient partie des 7,2 millions de vaccins J&J administrés. Ils concernaient des femmes âgées de 18 à 48 ans, qui souffraient d'une combinaison d'un type de caillot sanguin appelé thrombose du sinus veineux cérébral, ou CVST, et de faibles taux de plaquettes sanguines, une affection connue sous le nom de thrombocytopénie.

La combinaison d'une coagulation sanguine et d'une baisse des plaquettes, qui aident à former des caillots pour arrêter le saignement, "fait un schéma", a déclaré Peter Marks, directeur du Center for Biologics Evaluation and Research de la FDA, lors d'une conférence de presse le 13 avril. Et ce schéma a également été signalé en Europe dans relativement peu de cas parmi les millions de personnes qui ont reçu le vaccin AstraZeneca.

La fiche d'information révisée de la FDA pour les prestataires de soins de santé administrant le vaccin J&J indique désormais que les rapports d'événements indésirables aux États-Unis « suggèrent un risque accru de thrombose impliquant les sinus veineux cérébraux et d'autres sites … combiné à une thrombocytopénie et à l'apparition de symptômes d'environ un à deux semaines après la vaccination », notant que la plupart des cas concernaient des femmes âgées de 18 à 49 ans. L'avertissement indique : « Sur la base des preuves actuellement disponibles, une relation causale entre la thrombose avec thrombocytopénie et le vaccin Janssen COVID-19 est plausible.

Les vaccins AstraZeneca et J&J utilisent le même type de technologie - un adénovirus modifié et inoffensif pour inciter le corps à produire une réponse immunitaire au SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19. Cependant, les scientifiques de J&J ont souligné qu'il existe des différences dans la composition des vaccins.

Les agences américaines ont averti les prestataires de soins de santé que le médicament anticoagulant normalement utilisé pour traiter les caillots sanguins, l'héparine, peut être dangereux dans ces cas et que des traitements alternatifs doivent être administrés.

Lors de la réunion de l'ACIP du 23 avril, le Dr Tom Shimabukuro, chef de l'équipe de sécurité des vaccins du CDC, a déclaré dans sa présentation qu'il y avait eu, au 21 avril, un total de 15 cas confirmés, dont trois décès. Sept des 15 restent hospitalisés, dont quatre en soins intensifs, a-t-il précisé.

Sur les 15 cas au total, 13 sont survenus chez des femmes âgées de 18 à 49 ans et deux, tous deux divulgués le 23 avril, concernaient des femmes âgées de 50 à 64 ans.

Shimabukuro a appelé cette maladie rare de la coagulation thrombose avec syndrome de thrombocytopénie, ou TTS.

Dans quelle mesure ces deux affections sont-elles rares ou courantes : les caillots sanguins et les faibles taux de plaquettes ?

Ce type de caillot sanguin — thrombose du sinus veineux cérébral, ou CVST — est rare. Il se produit dans les veines des sinus qui drainent le sang du cerveau.

Elle survient chez 2 à 14 personnes sur 1 million chaque année dans la population générale, selon Marks.

Une présentation du CDC du 15 avril pour les cliniciens comprenait des estimations similaires du risque attendu (0,5 à 2 pour 100 000 personnes) et a déclaré que la CVST s'est produite dans environ 0,5% à 1% de tous les accidents vasculaires cérébraux. L'âge médian des patients était de 37 ans. La condition était trois fois plus fréquente chez les femmes.

Les facteurs de risque comprenaient des affections prothrombotiques, c'est-à-dire une tendance à développer des caillots sanguins, des pilules contraceptives pendant la grossesse et une infection cancéreuse post-partum et une ponction lombaire.

Vaccin COVID-19 de Janssen. (Photo d'Europa Press via Getty Images.)

Le CDC a déclaré que les cas après la vaccination J&J étaient au moins trois fois plus élevés que le taux attendu de CVST pour les femmes du groupe d'âge 20-50 ans. « Les cas observés après les vaccins Janssen COVID-19 semblent dépasser les attentes sur la base des taux de base de CVST chez les femmes âgées de 20 à 50 ans (3 fois ou plus), a indiqué la présentation, faisant référence à Janssen Biotech Inc., un Société pharmaceutique Johnson & Johnson.

Mais dans tous les cas, les patients présentaient également de faibles taux de plaquettes sanguines.

Un faible niveau de plaquettes, sans CVST d'accompagnement, est plus fréquent. Le Dr Robert Brodsky, directeur de la division d'hématologie et professeur de médecine à Johns Hopkins Medicine, nous a dit : « Nous avons tout le temps des gens avec un faible nombre de plaquettes.

Mais le taux attendu dans la population générale de la combinaison de CVST et de faibles niveaux de plaquettes sanguines est inconnu, a déclaré le CDC lors de sa présentation du 15 avril.

Quelles similitudes existe-t-il entre ces cas et la thrombocytopénie induite par l'héparine ?

Ces cas signalés après la vaccination avec les vaccins J&J et AstraZeneca semblent être similaires à la thrombocytopénie induite par l'héparine, ou TIH, une affection dans laquelle le corps a une réponse immunitaire après qu'un patient a reçu l'héparine anticoagulante, provoquant à la fois de faibles taux de plaquettes sanguines et caillots sanguins. "Il semble qu'il y ait un chevauchement entre les deux troubles", nous a dit le Dr Mortimer Poncz, chef de division d'hématologie pédiatrique à l'Hôpital pour enfants de Philadelphie.

Avec HIT, les anticorps se fixent au facteur plaquettaire 4, une protéine des plaquettes sanguines. Les patients peuvent être testés pour ces anticorps. Onze des 15 cas américains survenus après la vaccination J&J se sont révélés positifs pour l'anticorps HIT, et les résultats des anticorps n'étaient pas disponibles pour les autres cas, selon la présentation de Shimabukuro le 23 avril.

Des études en Europe ont également révélé des tests d'anticorps HIT positifs pour les cas impliquant des caillots sanguins et une faible numération plaquettaire quelque temps après avoir reçu le vaccin AstraZeneca.

Brodsky a déclaré qu'avec les rapports après les vaccins J&J et AstraZeneca, les "manifestations cliniques ressemblent à" HIT. Et Poncz a déclaré qu'il existe des "différences subtiles" qui, par exemple, suggèrent des anticorps dans le HIT et les cas de vaccins "peuvent reconnaître ou non des cibles distinctes sur le PF4".

En ce qui concerne la fréquence normale de la TIH, Poncz a fourni des statistiques qui ne s'appliqueraient qu'aux personnes hospitalisées qui reçoivent des formes du médicament héparine. Dans cette population, la TIH se produit dans environ 1 cas sur 100 pour l'héparine non fractionnée et 1 sur 1 000 pour l'héparine de bas poids moléculaire, a-t-il déclaré. C'est plus fréquent chez les personnes âgées.

"La thrombocytopénie est souvent bénigne", a déclaré Poncz à propos des cas de TIH, "mais la thrombose dans les veines plus que dans les artères peut être frappante, entraînant la perte d'un membre ou la perte de la vie."

Cependant, le CVST, le type de caillot sanguin dans les six premiers cas aux États-Unis, est «rare dans le HIT», a-t-il déclaré, ainsi que les caillots abdominaux. L'occurrence du CVST se démarque dans ces cas après la vaccination, a déclaré Poncz dans une interview une semaine après que le CDC et la FDA ont recommandé une pause.

"Il existe d'autres causes d'une combinaison du paradoxe d'une faible numération plaquettaire (qui provoque des saignements) et d'une thrombose", a déclaré Poncz dans un e-mail, citant une maladie auto-immune appelée syndrome des antiphospholipides, septicémie et COVID-19 sévère. Avec un COVID-19 sévère, "c'est plus un processus diffus dans tout le corps".

Maintenant que les fournisseurs de soins de santé savent qu'il ne faut pas utiliser d'héparine, dans quelle mesure la combinaison de conditions est-elle traitable ?

Poncz nous a dit que la reconnaissance précoce et l'utilisation d'autres anticoagulants sont importantes, et qu'il existe de nouvelles thérapies efficaces pour certains cas. Mais le traitement est « toujours un défi important. Cela n'élimine pas le risque de perte d'un membre ou de la vie.”

Quelle est la fréquence de ces cas parmi ceux qui ont reçu le vaccin J&J et ceux qui ont reçu le vaccin AstraZeneca en Europe ?

Aux États-Unis, les 15 cas de TTS représentent près de 2 sur 1 million des près de 8 millions de vaccins J&J administrés au 21 avril. Étant donné que 13 de ces cas concernaient des femmes de moins de 50 ans, l'incidence serait de 7 sur 1 million pour les femmes d'âge 18 à 49 ans. (Le CDC a déclaré que près de 1,9 million de doses de vaccin J&J avaient été administrées aux femmes de ce groupe d'âge au 21 avril.)

Mise à jour, 26 mai : Au 24 mai, le CDC et la FDA avaient identifié 32 cas au total parmi plus de 10,2 millions de vaccins J&J administrés. Il y a eu trois décès liés à l'état de coagulation du sang, au 7 mai, selon le CDC.

Brodsky a déclaré qu'il y avait un large éventail parmi les pays examinant les cas de caillots sanguins avec un faible nombre de plaquettes, le haut de gamme étant de 1 sur 250 000 en Norvège.

La plupart des cas dans le monde concernent des femmes, a-t-il déclaré, et beaucoup d'entre elles ont moins de 50 ans. Ce sont des complications « rares et très graves mettant la vie en danger » qui ont tendance à survenir chez les femmes plus jeunes, mais pas exclusivement mentionné.

Brodsky a déclaré qu'il y avait clairement une association avec le vaccin qui semble être plus élevée que ce à quoi vous vous attendriez dans la population générale. Pour mettre les choses en perspective, l'Allemagne estime 9 fois plus que ce à quoi vous vous attendriez dans la population générale. Comme nous l'avons dit ci-dessus, le CDC a estimé une incidence 3 fois plus élevée que ce à quoi on pourrait s'attendre. Mais c'est encore très rare, a déclaré Brodsky.

Un reportage du 11 avril dans Science a déclaré qu'il y avait eu au moins 222 cas suspects signalés en Europe après que 34 millions de personnes aient reçu leur première dose du vaccin AstraZeneca. Ce serait un taux de 6,5 pour 1 million.

Le comité de sécurité de l'Agence européenne des médicaments a déclaré le 7 avril que "les caillots sanguins inhabituels avec un faible nombre de plaquettes sanguines devraient être répertoriés comme des effets secondaires très rares" du vaccin AstraZeneca, également connu sous le nom de vaccin Vaxzevria. Le 20 avril, il a déclaré qu'"un avertissement concernant les caillots sanguins inhabituels avec un faible nombre de plaquettes sanguines devrait être ajouté aux informations sur le produit" pour le vaccin J&J, indiquant que les conditions étaient "très rares" et que les avantages du vaccin vaccin “l'emportent sur les risques d'effets secondaires.”

Comment ces rares incidents de coagulation se comparent-ils au risque de mourir du COVID-19 ?

Même parmi le groupe considéré comme le plus touché, les femmes âgées de 18 à 49 ans, il y a plus de chances de mourir du COVID-19 que de souffrir de ce syndrome de coagulation très rare.

Shimabukuro, chef de l'équipe de sécurité des vaccins du CDC, a déclaré dans sa présentation du 23 avril qu'il y avait 15 cas signalés de TTS chez 7,98 millions de personnes qui avaient reçu le vaccin J&J, au 21 avril. C'est un taux signalé de 1,88 cas par million de doses administrées.

Comme nous l'avons dit, le taux de cas signalés est encore plus élevé pour les femmes âgées de 18 à 49 ans. Selon la présentation de Shimabukuro, il y a eu 1 866 294 doses du vaccin J&J administrées aux femmes de 18 à 49 ans et un taux de cas signalés de 7 pour million.

En ce qui concerne les décès dus au COVID-19, le CDC rapporte le nombre total de décès par groupes d'âge et le pourcentage de décès par sexe.

Au 20 avril, le site Web du CDC contenait des données sur 437 186 décès par groupe d'âge, dont 19 727 décès pour les 18 à 49 ans. Les femmes de 18 à 49 ans représentaient 34,7% des 19 727 décès, ce qui signifie qu'elles représentaient 6 841 décès. À l'aide des estimations de population du Census Bureau pour 2019, nous avons déterminé qu'il y avait 100 décès dus au COVID pour 1 million de femmes âgées de 18 à 49 ans.

Vous trouverez ci-dessous un graphique des décès dus au COVID-19 pour 1 million d'habitants par groupe d'âge pour les deux sexes.

De toute évidence, les personnes âgées sont les plus à risque de mourir de COVID-19 et même chez les femmes plus jeunes, le risque est plus élevé que le rare problème de coagulation identifié chez les personnes qui ont reçu le vaccin J&J. Pourtant, Brodsky a déclaré que le risque potentiel n'est pas quelque chose qui devrait être ignoré. « Votre avantage d'un vaccin et le risque de mourir du COVID changent vraiment avec l'âge. »

Pour une femme de 75 ans qui fait de l'embonpoint et souffre d'affections telles que le diabète et l'hypertension artérielle, « absolument ce vaccin sera plus utile que nocif. » Pour une femme de 28 ans en bonne santé, qui a une chance négligeable, voire nulle, de mourir de COVID. "Je ne sais pas", a-t-il dit. “Surtout si d'autres vaccins sont disponibles.”

Les vaccins ont-ils été liés à d'autres troubles de la coagulation?

Quant aux autres vaccins COVID-19 autorisés aux États-Unis, il y a eu des rapports de thrombocytopénie, les plaquettes sanguines faibles, mais pas en combinaison avec des caillots sanguins chez quelques receveurs des vaccins Pfizer/BioNTech et Moderna. Que ce soit une causalité ou une coïncidence n'est pas encore connu, le Dr Paul Offit, directeur du Vaccine Education Center à l'Hôpital pour enfants de Philadelphie et membre du comité consultatif sur les vaccins et produits biologiques connexes de la FDA, nous a dit .

Une étude qui a examiné 20 rapports de thrombocytopénie après la vaccination avec ces injections a déclaré que "l'incidence" apparaît soit inférieure ou à peu près comparable à ce qui serait observé si les cas étaient une coïncidence après la vaccination. 19 dans le Journal américain d'hématologie, a conclu qu'il était « impossible à l'heure actuelle » de faire la distinction entre une maladie induite par le vaccin et une maladie fortuite.

Le CDC dit que « les femmes de moins de 50 ans doivent être particulièrement conscientes du risque rare de caillots sanguins avec un faible nombre de plaquettes après la vaccination » avec le vaccin J&J « et que d'autres vaccins COVID-19 sont disponibles là où ce risque n'a pas été observé. . "

Offit a déclaré que la thrombocytopénie était survenue chez 1 sur 25 000 à 30 000 receveurs du vaccin contre la rougeole, les oreillons et la rubéole. Mais l'infection naturelle de la rougeole peut conduire à la maladie, il n'est donc pas surprenant qu'un vaccin à virus vivant affaibli le fasse, mais plus rarement, a-t-il déclaré.

Mais ces événements, a déclaré Offit, sont "complètement différents" des cas signalés de thrombocytopénie et de caillots sanguins après la vaccination J&J.

Mise à jour le 30 avril : cet article a été mis à jour avec des informations de la FDA et du CDC.

Mise à jour le 23 avril : cet article a été mis à jour pour refléter les nouvelles données et informations de la réunion ACIP du 23 avril.

Mise à jour du 26 mai : nous avons ajouté de nouvelles informations sur le nombre de cas identifiés par le CDC et la FDA.

Note de l'éditeur : le projet COVID-19/Vaccination de SciCheck est rendu possible grâce à une subvention de la Fondation Robert Wood Johnson. La fondation n'a aucun contrôle sur nos décisions éditoriales et les opinions exprimées dans nos articles ne reflètent pas nécessairement les vues de la fondation. L'objectif du projet est d'augmenter l'exposition à des informations précises sur le COVID-19 et les vaccins, tout en réduisant l'impact de la désinformation.

Q : Les employeurs, les collèges et les universités peuvent-ils exiger les vaccins COVID-19 ?


« événement de désorientation » est-il un terme courant parmi les biologistes ? - La biologie

Départs : 19 novembre 2019 — 19h00 HNE

Prend fin : 19 novembre 2019 — 21h00 HNE

Emplacement

Centre de conférence Liberty Station,

Organisé par Raisons de croire, BioLogos, Université Nazaréenne de Point Loma

Rejoignez-nous pour un enregistrement en direct du nouveau podcast BioLogos, « Language of God ». L'animateur Jim Stump animera une discussion entre les dirigeants et les spécialistes de BioLogos et de Reasons to Believe, notamment Deborah Haarsma, Hugh Ross, Darrel Falk et Fuz Rana.

BioLogos et Reasons to Believe sont deux des organisations les plus importantes qui mènent la conversation entre le christianisme biblique et la science contemporaine. Pendant des années, ces organisations ont nourri un dialogue caritatif sur leurs domaines d'accord (comme l'autorité biblique et l'âge de la terre) et de désaccord (comme l'évolution et les origines humaines).

Cette soirée mettra en vedette des conversations engageantes et fascinantes entre les dirigeants et les universitaires de BioLogos et de Reasons to Believe sur des questions telles que les origines, ce que cela signifie d'être humain, les tendances du paysage scientifique et religieux et leurs efforts communs pour nourrir un monde nouveau et plus caritatif. conversation autour des questions de création et d'évolution.

Cet évènement est gratuit et ouvert au public.

Cet événement est parrainé par Reasons to Believe, BioLogos et Point Loma Nazarene University.


Biologie des systèmes telle que définie par le NIH

Auparavant, c'était aussi simple que "l'os du genou relié à l'os de la cuisse". Maintenant, les scientifiques utilisent des approches de biologie des systèmes pour comprendre la grande image de la façon dont toutes les pièces interagissent dans un organisme. L'illustration ci-dessus représente un interactome, l'ensemble des interactions moléculaires dans les cellules. L'interactome est considéré comme une ressource essentielle en biologie des systèmes.

Demandez à cinq astrophysiciens différents de définir un trou noir, dit le proverbe, et vous obtiendrez cinq réponses différentes. Mais demandez à cinq chercheurs biomédicaux de définir la biologie des systèmes, et vous obtiendrez 10 réponses différentes. . . ou peut-être plus.

La biologie des systèmes est une approche de la recherche biomédicale pour comprendre l'ensemble, que ce soit au niveau de l'organisme, du tissu ou de la cellule, en assemblant ses morceaux. Cela contraste fortement avec des décennies de biologie réductionniste, qui consiste à démonter les morceaux.

Pourtant, avec ses organigrammes compliqués qui peuvent (selon les mots de T.S. Eliot) « suivre comme un argument fastidieux d'intention insidieuse », la biologie des systèmes a effrayé plus d'un chercheur. D'autres encore ne parviennent pas à apprécier pleinement son utilité parce qu'il manque une définition concise et unifiée.

"Il [are] un nombre infini de définitions", a déclaré Ron Germain, chef du nouveau laboratoire de biologie des systèmes du NIAID, la première incursion organisée du NIH dans la biologie des systèmes, qui a duré près d'une décennie. "C'est encore pire que l'éléphant", cet éléphant infâme qui contrecarre les tentatives des aveugles de le décrire parce que chacun ne ressent qu'une partie.

"Certaines personnes y voient de la bioinformatique, prenant une énorme quantité d'informations et les traitant", a déclaré Germain. « L'autre école de pensée considère cela comme de la biologie computationnelle, c'est-à-dire des calculs sur le fonctionnement des systèmes. Vous avez besoin de ces deux parties.

Le nouveau laboratoire du NIAID reflète un voyage intellectuel que Germain et certains de ses collègues du NIH ont entrepris alors que le projet du génome humain touchait à sa fin.

Si le NIAID Systems Biology Laboratory était un orchestre symphonique, le chef du laboratoire Ron Germain en serait le chef-musicien. En tant que chef d'orchestre, Germain fournit la structure nécessaire au tempo et à l'harmonie. En tant que musicien, il fournit la base immunologique, essentiellement l'étude des macrophages. Il a recruté des membres « d'orchestre » pour le laboratoire qui ont les compétences nécessaires pour travailler seuls, mais qui sont également capables de travailler ensemble au nom de la biologie des systèmes.

A cette époque, vers 2001, la biologie était riche en données génomiques, la protéomique avait atteint sa maturité et les immunologistes avaient identifié de nombreux composants cellulaires et même moléculaires du système immunitaire. Pourtant, prédire le comportement du système immunitaire est resté aussi insaisissable que jamais.

Il était loin d'être clair qu'un laboratoire de biologie des systèmes puisse trouver des réponses. Mais malgré le risque, le directeur du NIAID Anthony Fauci et la directrice scientifique Kathy Zoon ont engagé un flux constant de ressources. Avec Germain, ils espéraient, et y ont consacré leur énergie, une nouvelle approche pour comprendre le système immunitaire qui engloberait mieux les techniques expérimentales et informatiques pour explorer les connexions dans toute leur splendeur complexe.

Le nouveau laboratoire, formé début 2011 à partir du Program in Systems Immunology and Infectious Disease Modeling (PSIIM), comprend Martin Meier-Schellersheim, chef de l'unité de biologie computationnelle Iain Fraser, chef de l'unité des systèmes de signalisation Aleksandra Nita-Lazar, chef de l'unité de protéomique des réseaux cellulaires John Tsang, chef de l'unité de génomique des systèmes et de bioinformatique et Germain, chef de la section de biologie des lymphocytes du NIAID, fournissant la base immunologique de cette opération.

Indépendamment, les chefs d'unité interagissent avec les laboratoires du NIH et au-delà pour établir et incorporer des méthodes de biologie des systèmes. Dans un véritable esprit d'équipe, ils travaillent ensemble pour attaquer les éléments les plus élémentaires de l'immunologie comme une réponse à une infection ou une vaccination.

Ironiquement, pour mieux comprendre ce nouveau laboratoire, nous devrions adopter une approche réductionniste pour définir ses parties. Le système, semble-t-il, est plus que la somme de ses parties.

Commencez par la modélisation informatique

Des modèles informatiques et des simulations sophistiqués font partie intégrante de la biologie des systèmes. En immunologie, ils sont nécessaires pour comprendre les réseaux biochimiques complexes qui régulent les interactions entre les cellules du système immunitaire et entre ces cellules et les organismes infectieux.

Entre Martin Meier-Schellersheim, physicien de formation. Il a été le premier à rejoindre l'entreprise du NIAID en 2001, avant même le lancement du PSIIM. Il a le plus réussi à habiliter les biologistes non computationnels à faire de la biologie computationnelle. En effet, il a contribué à favoriser le concept même d'équipe qui sous-tend le nouveau laboratoire. Son logiciel apporte une capacité de calcul avancée à un large éventail de biologistes.

Cette implication volontaire des biologistes est primordiale car les modèles ont besoin de données expérimentales solides comme entrée et comme référence pour assurer des contrôles de réalité. Sinon, les modèles biologiques risquent d'être simplifiés à l'excès soit par manque de données, soit parce que leur développement souffre d'une mauvaise communication entre expérimentateurs et théoriciens.

Le principal outil logiciel de Meier-Schellersheim, appelé Simmune, facilite la construction et la simulation de processus biologiques multi-échelles réalistes. Il est également impliqué dans le développement en cours d'un langage de balisage de biologie des systèmes, SBML3, qui peut coder des modèles avancés de voies de signalisation cellulaire.

Ajouter un peu de biologie cellulaire

Iain Fraser, biochimiste et biologiste moléculaire intéressé par les mécanismes de signalisation cellulaire, est arrivé au NIH en 2008. En tant que membre principal du laboratoire à haut débit, il dispose de plusieurs outils puissants pour générer des ensembles de données clés. Ces ensembles de données alimentent finalement le logiciel de Meier-Schellersheim pour produire des modèles quantitatifs.

Les outils de Fraser comprennent des criblages internes d'ARNi à l'échelle du génome pour caractériser les relations de réseau de signalisation dans les cellules hématopoïétiques. De tels criblages commencent à identifier des composants clés dans les réseaux innés de détection de pathogènes immunitaires. Il interagit étroitement avec le groupe de criblage d'ARNi à l'échelle du NIH au NIH Chemical Genomics Center et également avec le consortium RNAi Global.

Fraser a déclaré que les réseaux de signalisation du système immunitaire peuvent être démêlés en utilisant des approches systématiques appropriées pour interpréter des ensembles de données complexes. Il donne l'exemple des récepteurs Toll-like (TLR), qui déclenchent une réponse cellulaire complexe qui active plusieurs voies de signalisation intracellulaire.

Une activation excessive peut conduire à des troubles inflammatoires chroniques. Une activation insuffisante peut rendre l'hôte sensible à l'infection. Des approches de dépistage impartiales peuvent aider à identifier les composants qui permettent au système immunitaire de maintenir un équilibre homéostatique face aux défis microbiens.

L'un des premiers succès de Fraser, en utilisant une approche de biologie des systèmes, a démontré comment une seule protéine kinase peut médier les effets anti-inflammatoires de l'adénosine monophosphate cyclique dans sa diaphonie avec TLR4.

Fraser résume son séjour au NIH en établissant «l'infrastructure de dépistage pour disséquer la réponse du macrophage à un large éventail de stimuli pathogènes».

Les membres « d'orchestre » du nouveau laboratoire de biologie des systèmes du NIAID comprennent (dans le sens des aiguilles d'une montre à partir du haut à gauche) Martin Meier-Schellersheim, chef de l'unité de biologie computationnelle Iain Fraser, chef de l'unité des systèmes de signalisation Aleksandra Nita-Lazar, chef de l'unité de protéomique des réseaux cellulaires et John Tsang, chef de l'unité Génomique des systèmes et bioinformatique.

Une généreuse portion de protéomique

Aleksandra Nita-Lazar développe de nouvelles méthodes pour obtenir des données quantitatives qui améliorent notre compréhension de la biologie cellulaire et canalisent également des informations clés dans la construction de modèles. Son domaine est l'analyse systémique du protéome, qui a pris du retard sur l'analyse de l'ADN en partie faute des outils nécessaires.

La différence provient de la nature accommodante de l'ADN. DNA is easily recognized, replicable, and relatively stable, whereas the folded structure of proteins can’t be amplified. Yet protein studies are essential in developing useful models for many reasons, Nita-Lazar said. Such studies can reveal the molecular constituents of a cell provide information about the biochemical state of the proteins and determine catalytic rates and the association and disassociation rates for molecular pairs.

Nita-Lazar uses mass spectrometry to investigate protein phosphorylation, the process of binding with a phosphate group, one of the most common modes of protein-function regulation. She can use the same protocols that Fraser helped develop, and the same cell types, to determine which proteins are phosphorylated in response to a particular stimulus, when they are phosphorylated, and how those data fit into what is known about the transcriptional response.

Nita-Lazar’s group, with Fraser’s group, has been harvesting from these screens the key components required for the signal to flow through a pathway and also for the induction of the inflammatory cytokine messenger RNAs that arise. “This kind of approach used to be dismissed as a fishing expedition,” said Nita-Lazar. The goal is not to catch that one big tuna, however nice that would be, but rather to see the whole school of fish, the entire ecosystem.

Mix Well with Genomics

The enormous amount of data being collected requires processing and analysis—computational tools plus genetics and genomics “to build things from the top down,” Germain said.

Enter John Tsang, the most recent member of Germain’s lab and the element that transformed the PSIIM into a full-fledged systems biology lab.

On the genomics side, Tsang collects and analyzes data on gene expression, miRNAs, epigenetic modifications, and commensal microbes, and he conducts experiments to connect signaling to gene expression. On the bioinformatics side, he develops and applies statistical tools for large and diverse data sets, such as data from microarrays and high-throughput screenings, with an eye toward network models that involve genes, proteins, miRNAs, and epigenetic states.

Tsang also heads bioinformatics at the trans-NIH Center for Human Immunology (CHI), using similar integrative genomics approaches to study the human immune system, such as immune reactions to the flu vaccine in patients.

A core theme for building network models is capitalizing on systematic perturbations and -omics technologies to measure genome-wide responses. From the TLR stimulations that Fraser studies to vaccinations and natural genetic variations in humans, “all are valuable perturbations to help us figure out the wiring and function of the underlying system,” said Tsang.

Oh, Right, Immunology Too

“So, what am I doing in all of this aside from raising money and pontificating?” Germain joked.

If the NIAID Systems Biology Laboratory could be considered a symphony orchestra, Germain would be its conductor-musician. As conductor, he provides the necessary structure for tempo and harmony. As the musician, he provides the immunology base, essentially the study of macrophages.

Germain has seen systems biology labs in which collaborations are more opportunistic than routine, the shortsighted result of building a building, adding smart people, and hoping it all works out. His strategy instead has been to recruit individuals with the necessary skill sets to work on their own but also to work together in the name of systems biology.

“We all have slightly different interests, but there is enough overlap between those interests for us to develop those core projects and for us to be invested in them,” said Fraser.

Don W. Fawcett, Emma Shelton

Macrophages and lymphocytes, the two types of immune cells pictured above, interact with their surroundings in complicated ways. NIH researchers are using systems biology approaches to understand the totality of such interactions.

All Together Now

To understand the response to infection or vaccination at an integrated level, the lab is studying the intersection of innate and adaptive receptor-dependent pathways and their control of gene networks. The researchers have bottom-up projects to understand and model the signaling within specific cell types at a fine-grained level.

And they have a top-down approach that uses inferences from perturbation analyses to probe the large-scale structure of the interactions not only at the cellular level, but also at the tissue and even the organism level.

To accomplish this grand goal, Germain said, the lab works in digestible chunks, focusing on pathogen sensing in key innate cells, such as macrophages, and the intersection of signaling by antigen receptors, cytokines, and TLRs in determining whether B cells become memory cells or long-lived plasma cells.

This process is critical for vaccine development. At the top-down level, the lab uses host genetics and microbiota variation to explore how the immune system’s set point is determined for responses to infections and vaccines.

This early into the chase, the lab has not yet published results on these pursuits, although a paper is pending on the lab’s work with CHI and the flu.

Towards a Trans-NIH Approach

Germain hopes the Laboratory of Systems Biology will serve “as an intellectual resource for people who are thinking in the systems mode and have their hands on these technologies [and want] to see how they could be applied to their work.”

He named the lab the Laboratory of Systems Biology with no mention of immunology or host-pathogen interaction to designate its raison d’être. Inspired by NIAID’s efforts, NCI and NHLBI are actively recruiting researchers to establish systems biology programs. NHLBI has just named Keji Zhao, senior investigator, as director of its new Systems Biology Center.

Meanwhile, the trans-NIH effort for a Center for Systems Biology is not dead. A search for a very senior systems biologist to develop and lead the center came up dry, and now the budgetary stresses have put the search on hold. But most NIH researchers understand that purely reductionist approaches to biology are no longer enough to solve complex biological problems and that integrated approaches are needed. David Levens (NCI), Dan Camerini (NIDDK), and Alan Michelson (NHLBI), along with Germain, continue to lead efforts for this trans-NIH initiative.

NIAID’s Laboratory of Systems Biology is “a smaller model of what the larger enterprise could be,” Germain said. The new lab “is very good for the NIH. We are getting applicants from top universities who want to come to the lab as fellows.”

And the NIH intramural research program is well suited for systems biology, with a long-term perspective and a retrospective review process that doesn’t require grant writing.

Germain helped change the NIH tenure process, too, to be sure that team science, and not necessarily a steady stream of published papers, is recognized and rewarded.

“Nothing happens if you don’t put work into it,” he added.

Reporter’s note:

Ron Germain does have his own definition of systems biology that he’s sticking to: a scientific approach that combines the principles of engineering, mathematics, physics, and computer science with extensive experimental data to develop a quantitative as well as a deep conceptual understanding of biological phenomena, permitting prediction and accurate simulation of complex (emergent) biological behaviors.


MEETING SOCIETY'S NEEDS

H ow D oes E volutionary B iology C ontribute to S ociety ?

In addition to the historical dimension, evolution is an important feature in our everyday lives. Evolution is happening all around us: in our digestive tracts, in our lawns, in woodland lots, in ponds and streams, in agricultural fields, and in hospitals. For shortlived organisms such as bacteria and insects, evolution can happen on a very short time scale. This immediacy brings evolutionary biology directly into the applied realm. Indeed, evolutionary biology has a long history and a bright future in terms of its ability to address pressing societal needs. Evolutionary biology has already made particularly strong contributions in the following areas:

Environment and conservation. Evolutionary insights are important in both conservation and management of renewable resources. Population genetic methods are frequently used to assess the genetic structure of rare or endangered species as a means of determining appropriate conservation measures. Studies of the genetic composition of wild relatives of crop species can be used to discover potentially useful new genes that might be transferred into cultivated species. Studies of wild plants' adaptations to polluted or degraded soils contribute to the reclamation of damaged land.

Agriculture and natural resources. The principles of plant and animal breeding strongly parallel natural evolutionary mechanisms, and there is a rich history of interplay between evolutionary biology and agricultural science. Evolutionary insights play a clear role in understanding the ongoing evolution of various crop pathogens and insect pests, including the evolution of resistance to pest-control measures. The methods of evolutionary genetics can be used to identify different gene pools of commercially important fish and other organisms, their migration routes, and differences in their physiology, growth, and reproduction.

Finding useful natural products. Many thousands of natural products are used in medicine, food production and processing, cosmetics, biotechnology, pest control, and industry, but millions of other potentially useful natural products have yet to be screened or even discovered. Evolutionary principles allow a targeted search by predicting adaptations to environmental selection pressures and by identifying organisms related to those that have already yielded useful natural products. Exploration of related species also has made it possible to develop natural products from more accessible relatives of rare species in which natural products have been found, as occurred when the rare and endangered Pacific yew was found to contain a substance that led to development of a drug (tamoxifen) useful in treating breast cancer.

Human health and medicine. Methods and principles from evolutionary biology have contributed to understanding the links between genes and human genetic diseases, such as cystic fibrosis. Evolutionary methods help to trace the origins and epidemiology of infectious diseases, and to analyze the evolution of antibiotic resistance in pathogenic microorganisms. Evolutionary principles are used to interpret human physiological functions and dietary needs. Methods developed by evolutionary geneticists are playing an important role in mapping defective human genes, in genetic counseling, and in identifying genetic variants that alter risks for common systemic diseases and responses to medical treatments.

Biotechnologie. The interplay between biotechnology and evolutionary biology holds great promise for application to important societal needs. As genetic engineering has reached the field implementation stage, evolutionary biologists have been prominently involved in risk assessment as well as interpretation of phenotypic consequences of trans-gene insertion. Finally, the automation of DNA sequencing has made it possible to reconstruct the precise genealogical relationship among specific genes, such as those of the human immunodeficiency virus (HIV).

Understanding humanity. Evolutionary biology has contributed greatly to human understanding of ourselves by describing our origins, our relationships to other living things, and the history and significance of variation within and among different groups of people. Evolutionary anthropologists, psychologists, and biologists have advanced hypotheses on the biological bases of human culture and behavior. In addition, the evolutionary framework for understanding humanity has had a profound impact on literature, the arts, philosophy, and other areas of the humanities.


Méthodes

Data source for VOZ gene family

For precise identification of VOZ transcription factor sequences, a Hidden Markov Model (HMM) profile was built from the DNA-binding domain [51] using the VOZ protein sequences in A. thaliana, V. vinifera, O. sativa et P. patens. Sequences were retrieved from the PlantTFDB database [57] and a multiple alignment was conducted using MAFFT (v7.310) [80]. Subsequently, the alignment was manually curated to obtain the VOZ DNA-binding domain (

217 aa in length) and a HMM profile was created by hmmbuild in the HMMER package (version 3.1) [81]. A total of 46 taxa with available genomes were selected to represent major linages in Viridiplantae, and species phylogeny was generated based on the APG IV taxonomy [59]. Sequence data were downloaded from Phytozome (v12.1) or obtained directly from the PlantTFDB v4.0 databases [57], further compared with NCBI records if available (listed in Additional file 1: Table S1), only the longest (primary) transcripts for alternatively spliced isoforms of VOZ genes were retained for further analyses. To guarantee reliable sequence alignments and phylogeny reconstructions, a final inspection was conducted to eliminate protein sequences with only partial coverage of the conserved VOZ DNA-binding domain.


DNA replication timing alterations identify common markers between distinct progeroid diseases

Progeroid syndromes are rare genetic disorders that phenotypically resemble natural aging. Different causal mutations have been identified, but no molecular alterations have been identified that are in common to these diseases. DNA replication timing (RT) is a robust cell type-specific epigenetic feature highly conserved in the same cell types from different individuals but altered in disease. Here, we characterized DNA RT program alterations in Hutchinson-Gilford progeria syndrome (HGPS) and Rothmund-Thomson syndrome (RTS) patients compared with natural aging and cellular senescence. Our results identified a progeroid-specific RT signature that is common to cells from three HGPS and three RTS patients and distinguishes them from healthy individuals across a wide range of ages. Among the RT abnormalities, we identified the tumor protein p63 gene (TP63) as a gene marker for progeroid syndromes. By using the redifferentiation of four patient-derived induced pluripotent stem cells as a model for the onset of progeroid syndromes, we tracked the progression of RT abnormalities during development, revealing altered RT of the TP63 gene as an early event in disease progression of both HGPS and RTS. Moreover, the RT abnormalities in progeroid patients were associated with altered isoform expression of TP63 Our findings demonstrate the value of RT studies to identify biomarkers not detected by other methods, reveal abnormal TP63 RT as an early event in progeroid disease progression, and suggest TP63 gene regulation as a potential therapeutic target.

Mots clés: DNA replication timing RT signatures TP63 progeroid diseases.

Déclaration de conflit d'intérêts

Les auteurs ne déclarent aucun conflit d'intérêt.

Les figures

RT abnormalities in HGPS. ( UNE ) Depiction of cell samples analyzed by…

Identification of an HGPS-specific RT…

Identification of an HGPS-specific RT signature. ( UNE ) RT differences between progeroid…

Les TP63 gene is a marker of HGPS. ( UNE ) Overlap analysis…

Altered RT of TP63 is…

Altered RT of TP63 is an early marker of progeroid diseases. ( UNE…

Model of TP63 alterations in…

Model of TP63 alterations in progeroid diseases. Schematic depiction of TP63 locus organization…


Liens connexes

Les références: A comparative encyclopedia of DNA elements in the mouse genome. Yue F, Cheng Y, Breschi A, Vierstra J, Wu W, Ryba T, Sandstrom R, Ma Z, Davis C, Pope BD, Shen Y, Pervouchine DD, Djebali S, Thurman RE, Kaul R, Rynes E, Kirilusha A, Marinov GK, Williams BA, Trout D, Amrhein H, Fisher-Aylor K, Antoshechkin I, DeSalvo G, See LH, Fastuca M, Drenkow J, Zaleski C, Dobin A, Prieto P, Lagarde J, Bussotti G, Tanzer A, Denas O, Li K, Bender MA, Zhang M, Byron R, Groudine MT, McCleary D, Pham L, Ye Z, Kuan S, Edsall L, Wu YC, Rasmussen MD, Bansal MS, Kellis M, Keller CA, Morrissey CS, Mishra T, Jain D, Dogan N, Harris RS, Cayting P, Kawli T, Boyle AP, Euskirchen G, Kundaje A, Lin S, Lin Y, Jansen C, Malladi VS, Cline MS, Erickson DT, Kirkup VM, Learned K, Sloan CA, Rosenbloom KR, Lacerda de Sousa B, Beal K, Pignatelli M, Flicek P, Lian J, Kahveci T, Lee D, Kent WJ, Ramalho Santos M, Herrero J, Notredame C, Johnson A, Vong S, Lee K, Bates D, Neri F, Diegel M, Canfield T, Sabo PJ, Wilken MS, Reh TA, Giste E, Shafer A, Kutyavin T, Haugen E, Dunn D, Reynolds AP, Neph S, Humbert R, Hansen RS, De Bruijn M, Selleri L, Rudensky A, Josefowicz S, Samstein R, Eichler EE, Orkin SH, Levasseur D, Papayannopoulou T, Chang KH, Skoultchi A, Gosh S, Disteche C, Treuting P, Wang Y, Weiss MJ, Blobel GA, Cao X, Zhong S, Wang T, Good PJ, Lowdon RF, Adams LB, Zhou XQ, Pazin MJ, Feingold EA, Wold B, Taylor J, Mortazavi A, Weissman SM, Stamatoyannopoulos JA, Snyder MP, Guigo R, Gingeras TR, Gilbert DM, Hardison RC, Beer MA, Ren B Mouse ENCODE Consortium. La nature. 2014 Nov 20515(7527):355-64. doi: 10.1038/nature13992. PMID: 25409824.

Conservation of trans-acting circuitry during mammalian regulatory evolution. Stergachis AB, Neph S, Sandstrom R, Haugen E, Reynolds AP, Zhang M, Byron R, Canfield T, Stelhing-Sun S, Lee K, Thurman RE, Vong S, Bates D, Neri F, Diegel M, Giste E, Dunn D, Vierstra J, Hansen RS, Johnson AK, Sabo PJ, Wilken MS, Reh TA, Treuting PM, Kaul R, Groudine M, Bender MA, Borenstein E, Stamatoyannopoulos JA. La nature. 2014 Nov 20515(7527):365-70. doi: 10.1038/nature13972. PMID: 25409825.

Principles of regulatory information conservation between mouse and human. Cheng Y, Ma Z, Kim BH, Wu W, Cayting P, Boyle AP, Sundaram V, Xing X, Dogan N, Li J, Euskirchen G, Lin S, Lin Y, Visel A, Kawli T, Yang X, Patacsil D, Keller CA, Giardine B Mouse ENCODE Consortium, Kundaje A, Wang T, Pennacchio LA, Weng Z, Hardison RC, Snyder MP. La nature. 2014 Nov 20515(7527):371-5. doi: 10.1038/nature13985. PMID: 25409826.

Topologically associating domains are stable units of replication-timing regulation. Pope BD, Ryba T, Dileep V, Yue F, Wu W, Denas O, Vera DL, Wang Y, Hansen RS, Canfield TK, Thurman RE, Cheng Y, Gülsoy G, Dennis JH, Snyder MP, Stamatoyannopoulos JA, Taylor J, Hardison RC, Kahveci T, Ren B, Gilbert DM. La nature. 2014 Nov 20515(7527):402-5. doi: 10.1038/nature13986. PMID: 25409831.

Mouse regulatory DNA landscapes reveal global principles of cis-regulatory evolution. Vierstra J, Rynes E, Sandstrom R, Zhang M, Canfield T, Hansen RS, Stehling-Sun S, Sabo PJ, Byron R, Humbert R, Thurman RE, Johnson AK, Vong S, Lee K, Bates D, Neri F, Diegel M, Giste E, Haugen E, Dunn D, Wilken MS, Josefowicz S, Samstein R, Chang KH, Eichler EE, De Bruijn M, Reh TA, Skoultchi A, Rudensky A, Orkin SH, cPapayannopoulou T, Treuting PM, Selleri L, Kaul R, Groudine M, Bender MA, Stamatoyannopoulos JA. Science. 2014 Nov 21346(6212):1007-12. doi: 10.1126/science.1246426. PMID: 25411453.

Comparison of the transcriptional landscapes between human and mouse tissues. Lin S, Lin Y, Nery JR, Urich MA, Breschi A, Davis CA, Dobin A, Zaleski C, Beer MA, Chapman WC, Gingeras TR, Ecker JR, Snyder MP. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Dec 2111(48):17224-9. doi: 10.1073/pnas.1413624111. Epub 2014 Nov 20. PMID: 25413365.

Le financement: NIH’s National Human Genome Research Institute (NHGRI), National Institute of General Medical Sciences (NIGMS), National Cancer Institute (NCI), National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases (NIDDK), Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development (NICHD), National Heart, Lung, and Blood Institute (NHLBI), National Institute of Environmental Health Sciences (NIEHS), National Institute on Drug Abuse (NIDA), National Institute of Mental Health (NIMH), National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NINDS), and NIH Common Fund Spanish Plan Nacional Wellcome Trust Howard Hughes Medical Institute National Science Foundation and the American Recovery and Reinvestment Act.


Borderline personality disorder

Another condition where significant gender disparities exist is borderline personality disorder. This is one of the long-term consequences of violence against women and its understanding and management require a significant rethink.

Borderline personality disorder is a female-dominant diagnosis that carries enormous stigma. Men can also be diagnosed with borderline personality disorder, but the presentation of the condition in men is often confounded by the diagnosis of “antisocial personality disorder”. This is a condition where a person experiences a long-term pattern of manipulating, exploiting, or violating the rights of others. This behaviour is often criminal.

Borderline personality disorder is a female-dominant diagnosis. from shutterstock.com

The hallmark symptoms of borderline personality disorder are deliberate self-harm such as cutting or burning, rage over apparently minor issues, mood swings, poor self-esteem, dissociation (feeling like you’re not in your own body), constant anxiety and difficulties with identity.

Over 80% of people (mainly women) diagnosed with this condition actually have early life traumas. These include incestuous sexual, physical abuse and emotional abuse or deprivation. Yet the condition is termed a “personality disorder”, which carries the connotation it is somehow the person’s fault and ignores the common causal agent of trauma in the majority of cases.

Biological, psychological and social factors all act together to cause mental illnesses, and these factors are different among men and women. We must acknowledge this and take a more gendered approach to treating men and women with mental ill health, which integrates a number of biological factors with particular behaviours and external events, to provide better outcomes.


Voir la vidéo: RÉCHAUFFEMENT CLIMATIQUE - EFFONDREMENT DE NOTRE CIVILISATION - Pic pétrolier Énergies Thinkerview (Janvier 2022).